Zweck und Ziele der AGGA sind Repräsentanz der vielfältigen Archivlandschaft im kirchlichen und religiösen Bereich der Schweiz, Dialog auf interkonfessioneller Basis und Zusammenarbeit unter den Mitgliedsarchiven, Kontakt zu speziell interessierten in der kirchlichen und religiösen Archivlandschaft der Schweiz ansässigen Institutionen und Verbände, schliesslich Vermittlung zwischen kirchlichen Archiven und Staats-/Stadt-/Kommunalarchiven.